モチベーション
以前にAlbert (2008)、
https://www.stat.berkeley.edu/~aldous/157/Papers/albert_streaky.pdf
を読んでやってみたことのJulia版です。
次の0と1の羅列はカルロス・ギーエン(カルロス・ギーエン - Wikipedia)という選手の2005年の打撃成績のデータで、ヒットを 1、アウトを 0 とコード化してある。
0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1
年間通しての打率は約 3 割 2 分。
上記のデータの20打席ごとの移動平均をとってみる。
ぼくは野球に詳しくないのだけれど、20 はおよそ 4 試合ごとの打席数とのこと。
こうして見てみるとある時期には 6 割を超えていたり、またある時期にはほとんど 0 に近かったりする。
これはギーエンという打者の「調子の波」だと言っていいだろうか。
パラメトリックブートストラップによる検定
調子の波が存在しない選手は、常にコンスタントな打率でヒットを出すから、その打撃成績を上記のように 0 か 1 かに符号化すると、それはベルヌーイ過程になる。
このコンスタントバッターを乱数でシミュレーションしてみる。
シミュレーションの方にもそれなりに意味ありげな波ができている気がするが、波の幅はギーエンのデータよりも狭い感じがする。
こうなってくるとちゃんと検定したくなるのが人情だろう。
帰無仮説:「ギーエンの0-1のプロセスがベルヌーイ過程である。」
対立仮説:「ギーエンの0-1のプロセスがベルヌーイ過程でない。」
モチベーションとなった例で出した移動平均から検定統計量を作ってみる。
- 移動平均のレンジ(the range of the moving averages)
- 移動平均のシーズン平均からの平均変動(the mean variation of the moving averages about the season average)
は移動平均、 は移動平均のウィンドウサイズ、 はトータルの打席数である。
この を Albert (2008) では "black" 統計量と呼んでいるが、なぜ "black" なのかはよくわからなかった。
帰無分布はシミュレーションで作れるので、シミュレートされた と観測された を比べてやれば p 値が出る。
はシミュレーションの試行回数、 は中の不等号を満たすときに 1 そうでなければ 0 の値を返す関数である。
検定統計量の分布をヒストグラムで示す。
まず :
次に
p 値はそれぞれ 0.0262、0.0286 で 5%水準で有意になった。
ベータ二項モデル
パラメトリックブートストラップによる検定からはギーエンには調子の波があるといえそうなことはわかった。
ただし B と R は打率や打席数に依存するため、選手間で調子の波の強さを比較したりはできない。
そこでベータ二項モデルを導入してギーエンのヒットの数をモデル化することを考える。
ギーエンのデータを 20 打席ごとに区切って次のように集計する。
ヒットの数 | 打席数 |
---|---|
5 | 20 |
5 | 20 |
7 | 20 |
10 | 20 |
10 | 20 |
10 | 20 |
6 | 20 |
9 | 20 |
4 | 20 |
4 | 20 |
6 | 20 |
7 | 20 |
4 | 20 |
2 | 20 |
6 | 20 |
5 | 20 |
5 | 14 |
ヒットの数は二項分布に従うと仮定する。
20打席ごとの二項分布の成功確率 の事前分布にベータ分布を置く。
ここでの工夫はベータ分布を以下のようにパラメタライズすること。
こうすると は打率に対応するパラメータ、 は打率の集中度に関するパラメータと解釈できる。
が大きいほどばらつきが小さくなる。
Albert (2008) に習い と に対して次の事前分布を仮定する。
ちなみにこの事前分布を外すと、MCMC がまったく収束しなかった(と昔の日記に書いてある)。
推定には Stan を使った。
Stan のコードはこう。
data { int<lower=0> N; int<lower=0> m; int<lower=0> n[m]; int<lower=0> x[m]; } parameters { real<lower=0, upper=1> p[m]; real<lower=0> K; real<lower=0, upper=1> eta; } model { x ~ binomial(n, p); p ~ beta(K*eta, K*(1-eta)); target += -(log(eta)+log1m(eta))-2*log(K); } generated quantities{ int<lower=0,upper=1> pred[N]; for(i in 1:N){ pred[i] = bernoulli_rng(p[i/20+1]); } }
と の事後分布のトレースプロットです。
まず:
次に:
MCMC を回すのと同時に generated quantities ブロックで0-1の予測分布を生成していた。
予測分布でもパラメトリックブートストラップによる検定と同様のことができる。
統計量の分布をヒストグラムで示す。
まず :
次に :
p 値はそれぞれ 0.1789、0.2906 で 5%水準では棄却されない。
つまりモデルはそこそこ当てはまっていることが伺える。
最後に予測分布から計算した移動平均の平均をプロットしてみる。
Julia のコード
using Plots using Distributions using Random using CmdStan set_cmdstan_home!(homedir()*"/projects/cmdstan") modBetaBinom = Stanmodel(name="BetaBinom", model=open(f->read(f, String), "./Documents/BetaBinom.stan"), nchains=4, num_warmup=2500,num_samples=2500) GuillenC = [0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1] moving_average(vs,w) = [sum(vs[i:(i+w-1)])/w for i in 1:(length(vs)-(w-1))] N = length(GuillenC) avg = mean(GuillenC) ma = moving_average(GuillenC,20) plot(ma,legend=false) hline!([avg]) png("./Desktop/ma.png") rng = Random.default_rng() Random.seed!(1) y = rand(Bernoulli(avg),N) ma_c = moving_average(y,20) plot(ma, label="obs",legend=:top) plot!(ma_c, label="sim") png("./Desktop/ma_sim.png") Bobs = mean(abs,ma.-avg) Robs = maximum(ma)-minimum(ma) function bootBlack(M,avg) B_boot = zeros(M) R_boot = zeros(M) for i in 1:M y = rand(Bernoulli(avg),N) ma_c = moving_average(y,20) B_boot[i] = mean(abs,ma_c.-avg) R_boot[i] = maximum(ma_c)-minimum(ma_c) end return B_boot, R_boot end Random.seed!(1) B_boot, R_boot = bootBlack(10000,avg) p_B = mean(B_boot.>Bobs) p_R = mean(R_boot.>Robs) histogram(R_boot,legend=false) vline!([Robs]) png("./Desktop/boot_R.png") histogram(B_boot,legend=false) vline!([Bobs]) png("./Desktop/boot_B.png") m = div(N,20) x = zeros(Integer,m+1) n = zeros(Integer,m+1) j = 0 for i in 1:m x[i] = sum(GuillenC[(j+1):(j+20)]) n[i] = 20 j += 20 end x[m+1] = sum(GuillenC[(j+1):N]) n[m+1]= N-j println(x) dat = Dict("N" => N, "m" => m+1, "n" => n, "x" => x) rc, samples, cnames = stan(modBetaBinom, [dat]) K=[samples[:,cnames.=="K",i] for i in 1:4] plot(K,legend=false) eta=[samples[:,cnames.=="eta",i] for i in 1:4] plot(eta,legend=false) predpos = [occursin("pred.",cnames[i]) for i in eachindex(cnames)] y_pred =[samples[:,predpos,1];samples[:,predpos,2];samples[:,predpos,3];samples[:,predpos,4]] function predBlack(ypred,avg) M = size(y_pred,1) B_boot = zeros(M) R_boot = zeros(M) for i in 1:M ma_c = moving_average(y_pred[i,:],20) B_boot[i] = mean(abs,ma_c.-avg) R_boot[i] = maximum(ma_c)-minimum(ma_c) end return B_boot, R_boot end B_pred, R_pred = predBlack(y_pred,avg) histogram(R_pred,legend=false) vline!([Robs]) png("./Desktop/pred_R.png") histogram(B_pred,legend=false) vline!([Bobs]) png("./Desktop/pred_B.png") mean(B_pred.>Bobs) mean(R_pred.>Robs) ma_pred = [moving_average(y_pred[i,:],20) for i in 1:10000] ma_predmean = mean(ma_pred,dims=1) plot(ma,legend=false) plot!(ma_predmean,legend=false) png("./Desktop/pred_ma_mean.png")
CmdStanのインストールは
1 CmdStan Installation | CmdStan User’s Guide
を参照。
set_cmdstan_home!(homedir()*"/projects/cmdstan")
の行は自分の環境のCmdStanのディレクトリのパスを入れること。
ぼくは毎回これを書いてるけど、もっとうまいやり方がありそうな気はする。